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真核轉錄組測序(RNA-seq)

項目介紹
參數
常見問題
應用案例

 

真核轉錄組測序(RNA-seq)

 

真核轉錄組測序(RNA-seq)采用高通量測序平臺,

對某個特定樣本狀態下轉錄的所有mRNA進行測序,

可全面快速分析mRNA序列和豐度信息,

又可對基因結構和產生的新轉錄本進行分析;

廣泛應用于生命科學、基礎醫學、農學研究領域。

 

用心服務每一個項目

多年轉錄組學項目經驗及多組學關聯分析經驗

已完成人、小鼠、大鼠等物種進行轉錄組測序分析,

豐富的RNA轉錄組與甲基化數據多組學關聯分析經驗

助力客戶在Genome BiologyNature CommunicationsEpigenetics等權威雜志發表多篇高水平論文。

 

科學方案設計

從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

每個項目需要專業、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質量研究成

 

 

 

樣本類型和要求

樣本類型

樣本要求

RNA

總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; RIN≥7;

細胞、組織樣本

按照送樣要求準備

備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

 

 

數據分析

通過reads與參考基因組比對,

獲得某個物種在特定條件下的轉錄信息,

系統全面的對基因表達定量和結構分析,

多樣本差異表達基因及功能富集分析,

結合項目背景和科學問題的數據亮點挖掘。

 

未找到相應參數組,請于后臺屬性模板中添加

 

案例分析: 轉錄組測序確定急性淋巴細胞白血病的一個不同亞型

Whole-transcriptome sequencing identifies a distinct subtype of acute lymphoblastic leukemia with predominant genomic abnormalities of EP300 and CREBBP. Genome Res. 2017 Feb;27(2):185-195.

研究者對231例兒童急性淋巴細胞白血病(ALL)樣本進行全轉錄測序分析,在54.1%例患者中發現了58個功能性和顯性融合基因,其中31個之前未報道。另外,研究者發現了一個獨特的兒童ALL亞型,其顯著特征主要與組蛋白乙酰轉移酶EP300CREBBP關聯的ZNF38基因重排有關。該研究結果表明基因融合是兒童ALL常見的一類基因組異常;另外,EP300/CREBBP引起的復發易位會導致表觀調控放松,并有可能作為潛在靶向治療的靶點。